Una situació de comensalisme bacteri que habiten al còlon de moltes espècies. E. coli és àmpliament utilitzat en la biologia, com un model simple de funció de cèl lules bioquímics i com una sèrie d'experiments de clonació moleculars. En estudis ambientals, és un indicador clau de contaminació de les aigües a causa d'efluents d'aigües residuals humana.