Omezení enzymy jsou proteiny, které nakrájíme na přesné DNA. Omezení mapy zachycují chromozomální pozice omezení enzym řezání webů. Jako biochemické "značení", nebo značkami určitých oblastí podél chromozomy jsou používány. Mapa bude detail pozice, kde je molekula DNA snížit o konkrétní omezení enzymy.