Ein Enzym, das spezifisch RNA oder einzeln-angeschwemmte DNA 5´ Mononucleotides degradiert. Reinwasser aus filamentösen Pilzes Aspergillus Oryzae, S ₁ Nuklease ist hinsichtlich der Reichweite einer Hybridisierung-Reaktion durch Entfernen der ungepaarte Regionen verwendet. Es wird auch verwendet, um die klebrigen Enden der Beschränkungsfragmente zu entfernen. In S ₁ zuordnen, die kodierende Region eines Gens wird durch Ausführen von mRNA-DNA-Hybridisierung und entfernen ungepaarten DNA mit S-₁-Nuklease erkannt.