Reaktionsbedingungen - insbesondere Temperatur, Salz differenziert und pH-Wert-, die vorgeben, das Glühen von einzeln-angeschwemmte DNA-DNA, DNA/RNA und RNA/RNA-Hybriden. Bei hohen Stringenz, Duplices bilden nur zwischen Strängen mit perfekte 1:1-Komplementarität; untere Stringenz ermöglicht glühen zwischen Stränge mit einer gewissen Diskrepanz zwischen Basen.