Οργανωμένες μικροβιακή συστήματα που αποτελείται από στρώσεις μικροβιακά κύτταρα επισυνάπτεται επιφάνειες, με πολύπλοκες διαρθρωτικών (π.χ., δικτύου polysacchrides) και λειτουργική (δηλαδή, αναερόβια degradion) χαρακτηριστικά. Μπορεί να αποτελέσει για παράδειγμα ρίζες, οργανικών καταλοίπων, καθώς και οι αγωγοί του νερού.