Una operación patrocinada o llevada a cabo por departamentos gubernamentales o agencias de tal manera que se asegure el secreto o encubrimiento. Una operación clandestina difiere de una operación encubierta en que se pone énfasis en el ocultamiento de la operación en lugar de ocultamiento de la identidad del patrocinador. En operaciones especiales, una actividad puede ser tanto secreto y clandestino y puede centrarse igualmente en consideraciones operacionales y actividades relacionadas con la inteligencia.