1) Coloration de bandes ou de segments de chromosomes, ce qui permet l'identification précise des chromosomes individuels ou des parties de chromosomes. Les applications comprennent la détermination des réarrangements chromosomiques dans les syndromes de malformation et de cancer, de la chimie de segments de chromosomes, changements chromosomiques au cours de l'évolution et, parallèlement à des études d'hybridation cellulaire, cartographie chromosomique.

2) Le traitement des chromosomes pour révéler les profils caractéristiques des bandes horizontales. Le baguage des patrons prêtent chaque chromosome une apparence distinctive pour les 22 paires de chromosomes humains nonsex et les chromosomes x et y peuvent être identifiés et distingués sans ambiguïté. Aussi des bandes permet la reconnaissance des délétions chromosomiques (perdu des segments), des duplications chromosomiques (segments excédentaires) et d'autres types de réarrangements structuraux des chromosomes.