Prosedur untuk menentukan urutan nukleotida fragmen DNA. Ada dua metode umum untuk melakukan hal ini:

• Maxam dan Gilbert teknik (kimia degradasi), yang menggunakan bahan kimia yang berbeda untuk memecahkan DNA ke dalam fragmen di pangkalan tertentu; atau

• teknik Sanger (disebut di-deoksi atau metode mengakhiri jaringan) menggunakan DNA polimerase untuk membuat rantai DNA baru, dengan deoksi di nukleotida (jaringan Terminator) untuk menghentikan rantai secara acak seperti tumbuh.

Dalam kedua kasus, fragmen DNA dipisahkan menurut panjang oleh polyacrylamide Elektroforesis, memungkinkan urutan untuk membaca langsung dari gel.