La mutagenesi in cui la mutuazione è causata dall'induzione in vitro diretta in modo specifico in una molecola di dna. Il metodo più comune include l'uso di una mutante oligo-nucleotide sintetizzata chimicamente che può diventare ibrido con il target della moleca del DNA. Il risultato di un abbinamento sbagliato che trasporta doppi di dna può essere trasferito in una cellula batterica e il mutante ripreso.