共有派生形質に基づいて生物間の進化関係を検出する手法。分岐論は、主に一緒にプリミティブと派生物を区別せずに一般的に相同性に基づいてグループ化された生物の進化や系統発生sytematicsとして知られている古いアプローチに取って代わった。