Sudėtingas tinklo specializuotų ląstelių, audinių ir organų, kurį atpažįsta ir ginti įstaiga iš užsienio medžiagų, visų pirma ligų sukelia mikroorganizmai, pavyzdžiui, bakterijos, virusai, parazitų ir grybai. Organų ir audinių imuninės sistemos, vadinamas limfinių organų, įtraukta į kaulų čiulpų, blužnis, užkrūčio liauka ir tonzilės. Imuninė sistema langelius įtraukti baltųjų kraujo kūnelių, pvz., B limfocitai (B ląstelių), T limfocitai (T ląstelių), dendritic langelius ir makrofagus susidaro tipiška. ŽIV infekcijos palaipsniui griauna imuninę sistemą.