DNR ilgio pokyčio, atsiradimo fragmentai, gaminami iš po skilimo su tipo II endonukleazės. Buvimas ar nebuvimas pripažinimo omis, kad ypač restrikcijos fermentų ilgio DNR skirtumai. RFLPs buvo iš pradžių nustatyti po atskyrimo suvirškintas genomo DNR hibridizacijos naudojant DNR zondai elektroforeze gelyje (Pietų analizė). Dabar jie paprastai aptinkami iš elektroforezės suvirškintas PGR produkto.