En av et par, eller en rekke variant former for et gen som oppstår ved et gitt locus i et kromosom. Alleler er symbolisert med samme grunnleggende symbolet (f.eks, B for dominerende) og b for recessiv; B₁, B₂,..., B _n for n additiv alleler på et locus). i en normal diploide celle finnes det to alleler av noen genet (en fra hver av foreldrene), som opptar samme relative posisjon (locus) på homologe kromosomer. Innenfor en befolkning kan det være mer enn to alleler av et gen.