Systematický názov a číslo, ktoré identifikujú enzým v odbornej literatúry. Priradeným Komisiou enzýmu, číslo ES pozostáva zo štyroch čísel oddelených bodkami: prvý klasifikuje enzým do jednej zo šiestich širokých skupín: 1. glyfosátoxidoreduktázy; 2. Transferases; 3. Hydrolýz; 4. Lyases; 5. Isomerases; 6. Ligases. Každá skupina je rozdelil do podskupín, každá podskupina do sub-sub-groups, a posledné číslo je špecifické pre enzým, napr, ES 3.1.21.1 je deoxyribonuclease ja.