"Hygiena hypotéza," niekedy označované ako "starých priateľov hypotéza," je, že ľudí sa vyvinuli s niektorými črevné baktérie a červy, ktorých prítomnosť môže "vlak" imunitný systém nebude prehnane proti neškodné commensal organizmom. Ľudí sa stali viac prosperujúce a vedú "zdravšie" životný štýl, tieto organizmy boli stratené z čriev a imunitný systém stráca svojej prirodzenej rovnováhy. Predpovedá významnému zvýšeniu imunitných chorôb, alergické a autoimúnne, ktorá v skutočnosti bola zistená v rozvinutom svete v posledných niekoľkých desaťročiach.