Endonucleases, ki priznavajo posebno osnovno zaporedij znotraj DNK helix, ustvarjanje dvojno sklop prekinil DNK.

Opomba: tipa omejitev encimi vežite na teh straneh priznanje, ampak naknadno rezano DNK na različnih mestih. Tipa II omejitev encimi tako zavezuje in rezano v njihovo priznanje ali ciljnih mest.