Förfaranden för bestämning av nukleotidsekvensen i en DNA-fragment. Det finns två vanliga metoder för att göra detta:

• Maxam och Gilbert tekniken (kemisk nedbrytning), som använder olika kemikalier för att bryta av DNA i fragment på särskilda grunder, eller

• Sanger tekniken (kallas di-deoxy eller kedja-avslutar metod) använder DNA-polymeras att ny DNA-kedjor, med di-deoxy nukleotider (kedjan terminators) att stoppa kedjan slumpmässigt när det växer.

I båda fallen separeras DNA-fragmenten enligt längd av polyakrylamid gelelektrofores, aktivera sekvens skall läsas direkt från gelen.