Islamiska organisationen bildades 1977 i Mindanao och de närliggande öarna. Hashim Salamat, stöds av etniska Maguindanaos från Mindanao, split från den Moro National Liberation Front (MNLF), som tio år senare undertecknade ett avtal avsäga sig sitt mål om självständighet för muslimska regioner och acceptera regeringens erbjudande av autonomi. The MILF vägrade att acceptera att accord. Mindanao-baserade Moros islamiska befrielsefront har cirka 2 900 soldater.