En av ett par, eller en serie av varianter av en gen som uppstår i ett visst område i en kromosom. Alleler är symboliseras med samma grundläggande symbol (t.ex., B för dominerande) och b för Recessiv; B₁, B₂,..., B _n för n tillsatsen alleler i ett lokus). i en normal diploida celler finns det två alleler av alla en gen (en från varje förälder), som upptar samma relativa position (locus) på homologa kromosomer. Inom en population kan finnas fler än två alleler av en gen.