ก่อตั้งขึ้นในปีค.ศ. 1979 นักศึกษาปาเลสไตน์อียิปต์ซึ่งได้แยกจากพี่น้องมุสลิมปาเลสไตน์ในฉนวน ผู้ก่อตั้งได้รับอิทธิพลจากการปฏิวัติอิสลามในอิหร่านเป็นแล้วกลับ และ militancy ขององค์กรนักศึกษาอิสลามอียิปต์ พวกเขารักษาปิดสัมพันธ์กับเรียนอิสลามอียิปต์รุนแรง บางคนได้เกี่ยวข้องกับการลอบสังหารของประธานาธิบดี Sadat และเป็นผล อนุมูลอิสลามปาเลสไตน์ถูกขับไล่ออกจากอียิปต์ และกลับไปฉนวน ที่พวกเขาอย่างเป็นกิจจะลักษณะเริ่มกิจกรรมของตนเป็นองค์กรญิฮาดอิสลาม ระหว่างเดอะไฟต์ หลายอื่น ๆ กลุ่มของญิฮาดอิสลามปาเลสไตน์ได้เกิดขึ้น แต่ฝ่ายที่มีชีวิตรอดเป็นคนนี้ ที่ศาสตราจารย์ Sami Arian อัลหลังทำงานด้วย