Polymorphism (q.v.) ที่ไซต์พื้นฐานที่เฉพาะเจาะจงในการเขียนโปรแกรมลำดับ อาทิ ที่ยึด 306 ในยีนเฉพาะเจาะจง บุคคลหนึ่งอาจเป็น heterozygous สำหรับ A และ G: allele คุณอาจมี A ที่ไซต์นี้ ในขณะที่ allele คุณมีตัว G ที่ไซต์นี้ ชนิดของ polymorphism นี้กว้างขวางตลอดทั้งจีโนมมนุษย์ และมีประโยชน์ที่ดีของการสามารถตรวจหาได้โดยไม่ต้องเจล electrophoresis ซึ่งวิธีการทำงานแบบอัตโนมัติขนาดใหญ่ของ genotyping เปิด