Hangi plazmid gösteren bir sınıflandırma düzeni tek bir hücre içinde bir arada. Plazmid, aynı hücrede bir arada için farklı uyumsuzluk gruplarına ait olması gerekir. Aynı uyumsuzluk grubunda plazmid aynı hücreye yerleştirilen kararsız. a plazmid vektör klonlama her zaman ana bakteri'nın endojen plazmid farklı bir uyumsuzluk grubuna ait.