Tổ chức hệ thống vi khuẩn bao gồm các lớp của các tế bào vi khuẩn gắn liền với bề mặt, với cấu trúc phức tạp (tức là, ngoại bào polysacchrides) và chức năng (tức là, kỵ khí degradion) đặc điểm. Có thể hình thành trên rễ, dư lượng hữu cơ, và ống dẫn nước ví dụ.