Một giao thức nghiên cứu phân biệt giữa "hộp đen" phương pháp tiếp cận nơi mà các nhà nghiên cứu sử dụng một chưa biết, và "trắng hộp" cách tiếp cận nơi mà kiến thức về cách hoạt động của một cái gì đó xác định các phương pháp được sử dụng để nghiên cứu nó. Và lớn, sinh thái học hạn chế bản thân để hộp đen phương pháp bằng cách nhìn vào sự kiện tự nhiên từ bên ngoài, "khách quan," trong khi sinh thái sâu, ecopsychology, và các quan điểm tương tác phấn đấu để liên lạc với các hoạt động bên trong của thiên nhiên.