Quá trình thay đổi sinh học và hữu cơ trong Vương quốc thực mà theo đó các đặc tính của nhà máy khác nhau từ thế hệ này sang thế hệ khác. Sự hiểu biết về quá trình thực sự tiến hóa dựa trên một số dòng của bằng chứng. Chính cấp (lớp) của sự tiến hóa đã từ lâu đã rõ ràng từ so sánh giữa các sinh vật, nhưng mẫu hóa thạch đã được quan trọng trong hẹn hò tiến hóa sự kiện và tiết lộ đã tuyệt chủng intermediates giữa các nhóm hiện đại, được ngăn cách nhau bởi khoảng cách hình thái học tuyệt vời (tiến hóa những thay đổi trong nhiều ký tự). Thực sự tiến hóa đã được làm rõ bởi cladistic phương pháp để ước tính các mối quan hệ giữa các nhóm sống và hóa thạch. Phương pháp nhằm tái tạo lại phân nhánh tiến hóa đường (cây phát sinh loài) bằng cách sử dụng sự đổi mới tiến hóa chia sẻ (ví dụ, sự hiện diện của một cấu trúc không tìm thấy trong nhóm khác) như là bằng chứng rằng các sinh vật cụ thể là hậu duệ của cùng một dòng dõi tổ tiên (một nhóm đơn ngành hay nhánh).