1.的一对核苷酸基地该窗体氢键彼此。腺嘌呤 (A) 对与胸腺嘧啶 (T) (或与尿嘧啶 (U) 在 RNA） 及鸟嘌呤 (G) 对与胞嘧啶 (C)。

2.一对线段或将的核酸股之一的 hydridize (由氢键连接) 彼此。