进程的开始与寻找标记链接到一个特定的继承特征，然后使用这些标记来标识负责性状基因的大概位置，然后使用各种克隆战略 （包括染色体步行，q.v.） 到识别、 隔离和特有的基因。最初，该战略叫 反向遗传学、 一词有些人认为是用词不当和误导性。