確定一個 DNA 片段的核苷酸序列程式。有兩種常用方法執行此操作：

• 使用不同的化學品，打破到 DNA 的 Maxam 和吉伯特技術 （化學退化），在特定的基地 ； 片段或

• （稱為 di 去氧或鏈終止方法） 的桑格技術就是利用 DNA 聚合酶，使新的 DNA 鏈，與迪去氧核苷酸 (鏈結束字元），隨機隨著停止鏈。

在這兩種情況下，根據長度分隔 DNA 片段聚丙烯醯胺凝膠電泳啟用要直接從凝膠中讀取的序列。