進程的開始與搜索標記連結到特定的繼承特徵，然後使用這些標記來標識負責性狀基因的大概位置，然後使用各種克隆戰略 （包括染色體步行，q.v.），到識別、 隔離和特有的基因。最初，該戰略被稱為 反向遺傳學、 一詞有些人認為是用詞不當和誤導性。